Après avoir battu Alcyone, Hikaru, Umi et Fû rencontrent Presea sur le conseil de Clef. L'armurière les charge d'aller à la source Eterna pour récupérer de l'escudo, un minerai essentiel à la confection de leurs armes. Mais bien qu'elles soient accompagnées par Mokona, le chemin est périlleux, et elles, encore bien inexpérimentées…

Grâce au concours de Ferio, les aspirantes Magic Knights parviennent à Eterna.  Mais la source est encore plus dangereuse qu'Alcyone… C'est au prix de leur sang que les amies  obtiennent leurs armes. Ainsi équipées, elles partent à la rencontre d'un Dieu-Rune  endormi dans un temple marin. C'est alors qu'un nouvel ennemi leur barre la route…

Alors que les affrontements s'intensifient, le chemin du pilier demeure introuvable. Il devient pourtant indispensable de désigner le prochain pilier car le temps presse pour Cefiro dont l'annihilation totale est proche. Pour la sauvegarde de ce monde, une ultime bataille bouleversante va se jouer pour les Magic Knights !

De nouveau convoquées à Cefiro, les Magic Knights découvrent un monde en ruine ! La disparition de la princesse Émeraude laissant vacant le rôle de pilier,  trois nations ennemies se bousculent à sa conquête et ont déjà tracé leur chemin vers  le château. Pourtant, malgré l'extrême convoitise qu'il suscite, le statut de pilier est-il si avantageux ?

Lors d'une sortie scolaire, Hikaru, Umi et Fû sont soudain transportées à Cefiro, un monde parallèle envahi de psycho-monstres. Pour retourner chez elles, ces collégiennes devront s'unir et délivrer la Princesse Émeraude, garante de l'harmonie et prisonnière du félon Zagato, que seules les trois “Magic Knights” peuvent vaincre !  Ce classique des CLAMP, arrivé en 1996  en France, fait des magical girls des figures héroïques mémorables. Cette nouvelle édition retraduite, en sens de lecture original, s'accompagne de bonus et d'illustrations couleur inédites issues des artbooks de la série.

Après avoir rallié à leur cause les sbires de Zagato, les Magic Knights parviennent à vaincre ce dernier grâce aux Dieux-runes. Mais la joie cède la place au désespoir lorsqu'elles se voient obligées d'abattre celle qu'elles étaient censées sauver. C'est la mort dans l'âme qu'elles retrouvent leur monde. Mais un nouvel appel retentit…