2017, dans l'Area 11, une colonie du Saint Empire de Britannia. Le jeune Lelouch Lamperouge se retrouve pris au milieu d'une opération militaire et obtient le Geass, le pouvoir de soumettre quiconque à sa volonté. Héritier du trône britannien vivant sous le sceau du secret et ayant de la rancune envers son père, Lelouch endosse le rôle de Zéro, un justicier Eleven qui veut détruire Britannia.