Le 6 août 1945, la canicule pèse sur Hiroshima. Soudain, un éclair aveuglant embrase toute la région, et un souffle dévastateur détruit la ville en quelques instants : la première bombe atomique de l'Histoire vient d'exploser sur l'archipel japonais. Yasuko, à bord d'un ferry en route vers la résidence de son oncle Shigematsu, reçoit avec les autres passagers la pluie noire radioactive. Cinq ans plus tard, Yasuko est en âge de se marier, mais la rumeur court qu'elle était sur les lieux de la tragédie après l'explosion...

Province d'Echizen, été 1913. En route vers Kyoto, le professeur Yamasawa traverse un village frappé par la sécheresse, perdu au milieu des montagnes. À proximité se trouve l'étang du Démon, objet de superstitions de la part des habitants. En effet, si la cloche du village ne sonne pas quotidiennement, le dragon retenu au fond de l'eau serait libéré et provoquerait un déluge mortel. L'arrivée de Yamasawa chez Akira et Yuri, le couple chargé de faire respecter cette tradition immuable, va bientôt mettre en péril cet équilibre...