9000 av.J.-C. Selon Platon se dressait au milieu de l'océan Atlantique une île habitée par un peuple de guerriers, une civilisation très en avance sur son temps qui pourtant a disparu en une nuit. En 2004, une exploration sous-marine menée par Jack Howard et son équipe découvre un disque en or massif qui pourrait être la clé d'une cité perdue. Au même moment, le professeur Hiebermeyer découvre en Égypte, sur le corps d'une momie ptoléméenne un papyrus mentionnant le mot Atlantis, ainsi que la carte d'une cité perdue. Ces deux découvertes remettent en cause l'archéologie moderne en montrant que l'Atlantide est peut-être finalement plus qu'un mythe. Jack et Katya, archéologue russe, mènent l'enquête sur l'existence de cette civilisation et aussi sur les causes possible de sa disparition...