L'humanité s'est éteinte il y a des siècles, éradiquée par des formes de vie plus anciennes et plus sages. Lorsque John Prophet s'extrait de sa capsule après un long temps passé en cryostase, il a un objectif, ressusciter l'empire humain et activer la balise qui propagera à travers le cosmos le signal de réveil de ses clones, disséminés aux quatre coins de la galaxie.