En des temps reculés, d'effroyables formes de vie dominaient le monde. En sommeil depuis l'émergence de l'espèce humaine, elles n'attendent que l'alignement de certaines étoiles pour régner à nouveau. L'arrivée du Cthulhu est d'ailleurs imminente. Pour l'empêcher, l'Agence Lovecraft doit absolument récupérer la clé de R'lyeh, la cité engloutie où patiente le monstre impitoyable. Cette clé, Sergueï l'a aperçue quand il a été projeté dans le corps d'un Yithien des millions d'années en arrière. Le seul moyen de la récupérer est de retourner dans le passé et y semer des indices que Marie et Ryan devront retrouver dans le présent. Malheureusement, lors de ce nouvel échange de corps avec un Yithien, une erreur est commise et permet à une créature d'un autre temps d'atteindre l'agence Lovecraft, ce qui est précisément ce qu'elle cherchait à faire...