La vie de Tom Riley, 14 ans, bascule quand ses parents disparaissent mystérieusement. Son oncle n'a d'autre choix que de lui révéler la vérité : le monde est peuplé de créatures étranges protégées par l'Agence, une organisation secrète pour laquelle ses parents travaillent en tant que traqueurs. Tom intègre alors l'agence lui aussi pour suivre la même formation. Avec l'aide de ses amis apprentis traqueurs, il va poursuivre une enquête parallèle pour tenter de retrouver ses parents...