Malgré l'institutionnalisation des lobbies au niveau européen, les risques de conflits d'intérêts demeurent nombreux. La forte pression qu'exercent les groupes d'influence sur les parlementaires, associée à une vision strictement économique de l'Europe qui conduit souvent ces derniers à défendre les grandes entreprises de leur pays, rend nécessaire non seulement de nouvelles règles, mais aussi une plus grande responsabilité des élus.

Face à une Europe politique et sociale en panne, les entreprises accélèrent la construction de leur marché unique. Mais les Etats s'inquiètent et ne veulent pas renoncer à jouer un rôle.

La dimension risque est particulièrement visible chez les petites entreprises de biotechnologie, souvent nées des projets d'un entrepreneur qui assure l'ensemble de l'administration.