Avec le retour de Zéro, les hostilités reprennent de plus belle entre l'odre des Chevaliers Noirs et l'armée britannienne. Schneizel est décidé à arrêter son adversaire par tous les moyens, tandis que celui-ci a le projet de s'attaquer directement à la source de leurs pouvoirs : la secte du culte du Geass.