Les sols agricoles sont exposés à des composés chimiques exogènes, de nature biologique, organique ou minérale, via différentes voies d'entrée : l'application de pesticides et d'engrais chimiques, l'apport de matières d'origine résiduaire (effluents d'élevage, boues d'épuration...), l'irrigation avec des eaux usées ou encore les retombées atmosphériques. Les principaux processus impliqués dans la dissipation des pesticides dans les sols sont transposables aux autres contaminants chimiques exceptés les éléments traces métalliques qui, pour la plupart, ne sont pas biodégradables.