En septembre 2008, un charnier a été découvert près de l'aéroport de Dili, où étaient entassées des victimes de l'armée indoniésienne d'occupation (de 1975 à 2002). Celle-ci avait reçu le renfort de policiers, de militaires et de miliciens est-timorais, dont beaucoup restent impunis. Désormais, le pouvoir fait un choix largement contesté : celui de l'amnistie et de la réconciliation. Cette culture de l'impunité sape un certain nombre d'initiatives visant à établir un Etat de droit.