Un soir, alors qu'elle est dans le bus qui la ramène chez elle, Sakura aperçoit dans un parc plusieurs personnes consumées par d'étranges flammes bleues. Au milieu de ce brasier, le supposé responsable de ce crime, un garçon de son âge, contemple la scène, insensible aux cris de ses victimes. Quelle n'est pas sa surprise, le lendemain, quand ce jeune homme débarque dans sa classe au lycée. Sakura décide alors d'enquêter sur ce nouvel élève, Rei Ôgami, pour tenter de le confondre. Il lui apprend qu'il est un CODE:BREAKER, celui qui n'existe pas , chargé de débarrasser le monde de tous ceux que les lois n'atteignent pas grâce à ses pouvoirs !

A l'époque des samouraïs, l'histoire de Kyo, un personnage qui allie cruauté et douceur.

Kyo va à la rencontre de Tokugawa Ieyasu, mais ne trouve en face de lui qu'un pantin incapable. Le mystère sur la double personnalité de Kyo s'éclaircit avec la rencontre du samouraï Yukimura...

Yuya a compris qui est l'assassin de son frère. De son côté, Kyo est enfin face à celui qui en veut à sa vie. Un face-à-face attendu, sabre contre sabre...

Jimon se donne beaucoup de mal pour réveiller la deuxième personnalité de Kyô et le provoque. Son agressivité finit par porter ses fruits : le Kyô démoniaque se manifeste. Dans le même temps, on apprend que la femme à laquelle Kyô n'a pu enlever la vie autrefois s'appelle Okuni...

Kyo et Kyoshiro s'affrontent dans un duel à mort. Pourtant, la force de Kyoshiro Mibu est nettement supérieure à celle de Kyo aux yeux de démon. Les nombreux mystères qui entourent les deux hommes seront bientôt révélés.

Jimon se donne beaucoup de mal pour réveiller la deuxième personnalité de Kyô et le provoque. Son agressivité finit par porter ses fruits : le Kyô démoniaque se manifeste. Dans le même temps, on apprend que la femme à laquelle Kyô n'a pu enlever la vie autrefois s'appelle Okuni...

A l'époque des samouraïs, Kyo, un personnage qui dégage à la fois cruauté et douceur.

De nouveaux affrontements se tiennent sous le regard du grand Tokugawa Ieyasu. Kyô est à nouveau pris entre ses deux personnalités et ce dilemme prend une toute nouvelle tournure avec la révélation soudaine d'un passé trouble...

En tant que tueur envoyé par l'ex-roi rouge, Kyoshiro Mibu apparaît devant Kyo et les autres dans le véritable corps de Kyo. Un duel commence entre eux au cours duquel Kyo sombre dans l'inconscience. Alors que ce dernier pense ne plus pouvoir se révéler, Muramasa apparaît dans son esprit et grâce à lui, il finit par reprendre conscience.

Kyo n'a décidément pas que des amis : Benitora est lui aussi à la recherche du terrible Kyo. Les ennemis se multiplient. Kyoshiro doit parvenir à contenir son double sanguinaire...

Quatre années ont passé depuis la terrible bataille de Sekigahara et les samouraïs qui ont survécu sont aujourd'hui des nomades errants à la recherche d'un sens à donner à leur existence. Kyo est l'un d'eux. Avec des médicaments et des artifices dans ses bagages, il suit une route dont il ne sait où elle le conduira.

Quatre années ont passé depuis la terrible bataille de Sekigahara et les samouraïs qui ont survécu sont aujourd'hui des nomades errants à la recherche d'un sens à donner à leur existence. Kyo est l'un d'eux. Médicaments et artifices dans ses bagages, il suit une route dont il ne sait où elle mène.

Un homme et une femme parcourent le Japon du XIXe siècle au temps des samouraïs.

Une nouvelle dimension pour la dualité qui oppose Kyô et Kyôshiro : apparaît devant eux Sasuke Sarutobi, le plus fort des dix guerriers de Sanada. IL révèle des forces insoupçonnées, et provoque Kyô dans un tragique affrontement, par hostilité.

Le chemin vers le palais continue pour chaque groupe. Le trio composé de Tigre rouge, Akira et Luciole doit faire face à de sérieux problèmes. L'intrigant général Sanada apparaît devant l'équipe formée par Kyo et Bontenmaru et il leur annonce son intention d'accéder au pouvoir. Chacun devra lutter pour avancer dans les couloirs du palais.

Grâce aux aiguilles d'Anthony, Luciole a décuplé sa force. Anthony et sa famille demandent à Luciole de vaincre son maître Yuan. Les deux hommes s'engagent dans un combat sans merci mais Yuan est sur le point de vaincre Luciole.

Luciole finit par s'écrouler face à Shinrei. Au moment où la vie de Yuka semble s'éteindre, Kyo se synchronise avec Kyoshiro et lance le coup secret du vent divin obscur : le Byakko. Mais un autre obstacle se dresse : Akari des Quatre Sacrés du ciel fait son apparition.

Kyoshiro Mibu a investi le corps de Kyo et annonce qu'il va devenir le roi rouge. Il emporte Yuya vers la Tour rouge afin de tenter de soigner ses blessures.

Arrivé à l'étape de la cinquième porte, Shinrei déploie toutes ses forces pour terrasser Kyo. Luciole intervient alors dans le combat et tente de libérer Shinrei de l'influence du clan. Un combat à mort va opposer les deux demi-frères à la dernière des cinq portes.

Kyo aux yeux de démons et Nobunaga s'affrontent en duel. Au beau milieu de ce combat, Yuya Shiina est de nouveau confrontée à la mort et Kyo se retrouve dans une impasse. C'est alors que son véritable corps apparaît devant lui.

Taihaku, dieu de la guerre, veut protéger les Mibu qu'il considère comme un mal nécessaire. Tigre rouge est persuadé de la force des sentiments et veut bâtir une paix pour tous. Tandis qu'à la quatrième porte, deux hommes au grand coeur vont confronter leurs convictions.

Julian rejoint Kyo et commence à chanter. Kyo s'énerve et Julian contrarié vole le Shibien et le Tenrô sans même que Kyo ou Sasuke ne s'en aperçoive.

Grâce aux puissants Quatre sacrés du ciel, Kyo et sa bande parviennent devant le palais du Yin et du Yang. Parmi les quatre passages, un seul permet d'accéder au palais. Kyo et sa bande se séparent en 4 groupes mais de terribles ennemis attendent chacun d'entre eux.

Le corps de Kyo aux yeux de démon, censé demeurer immobile a bougé subitement. Il reçoit des nouvelles de la mystérieuse Shihodo, qui ne l'enchantent pas.

Le chemin vers le palais continue pour chaque groupe. Le trio composé de Tigre rouge, Akira et Luciole doit faire face à de sérieux problèmes. L'intrigant général Sanada apparaît devant l'équipe formée par Kyo et Bontenmaru et il leur annonce son intention d'accéder au pouvoir. Chacun devra lutter pour avancer dans les couloirs du palais.

Les vrais 12 Généraux sacrés surgissent devant Kyo et ses amis, en route pour le palais du Yin et du Yan. Akari, en colère contre Mékira, qui vole la vie des gens grâce à sa technique des yeux de la méduse, déploie la main gauche interdite. Sasuke tombe, lui, sous l'emprise du souffle de la sirène d'Indara. Toutefois au moment où la situation semble désespérée, le véritable Sasuke s'éveille.

Le combat entre les deux samouraïs Akira et Saisei commence. Face au génie d'Akira, Saisei va devoir dévoiler sa véritable identité. Manga.

Taihaku, dieu de la guerre, veut protéger les Mibu qu'il considère comme un mal nécessaire. Tigre rouge est persuadé de la force des sentiments et veut bâtir une paix pour tous. Tandis qu'à la quatrième porte, deux hommes au grand coeur vont confronter leurs convictions.

Le combat entre les deux samouraï Akira et Saisei commence. Face au génie d'Akira, Saisei va devoir dévoiler sa véritable identité. Le gardien de la 3e porte n'est autre que le mystérieux Chinmei des Cinq Planètes. Face à Chinmei, Kyo est hanté par des souvenirs difficiles et une terrible haine. L'affaire tragique à l'origine de sa discorde avec Mahiro ressurgit du passé. Manga.