Cet article traite de l'évolution des conflits religieux dans l'Irlande moderne, à partir de 1500 environ, jusqu'à la fin de l'Interrègne en 1660. Au début de la période, l'Irlande était extrêmement divisée d'un point de vue politique. D'un point de vue religieux, le monde de la chrétienté irlandaise était assez différent du modèle du catholicisme de la fin du Moyen Age. La Réforme en Irlande eut des origines presque entièrement étrangères. Le protestantisme attira peu de fidèles parmi la population irlandaise gaélique ou dans la communauté anglaise pré-élisabéthaine.