Le Mucem à Marseille est l'héritier du musée national des Arts et Traditions populaires (MNATP), lui-même issu du musée d'Ethnographie créé en 1879 à Paris au palais du Trocadéro. Ce projet architectural et culturel, qui accordait initialement une place centrale aux collections documentaires de la bibliothèque, a toutefois vu celles-ci basculer du côté du Centre de conservation et de ressources, à la Belle-de-mai et non plus au fort Saint-Jean, scindant de facto les collections du public se rendant au musée, au risque d'un contresens en termes d'action culturelle.

Le musée des Civilisations de l'Europe et de la Méditerranée (MuCEM) ouvre ses portes en juin 2013 à Marseille. A travers ses collections permanentes et des expositions temporaires, il montrera la spécificité des civilisations méditerranéennes.